O Alto Parnaíba, incluindo as nascentes, mede 766 quilômetros. Caracteriza-se pela abundância de brejos, riachos e rios.
De Santa Filomena a Uruçuí o rio apresentava muitas cachoeiras. Destacavam-se a Pedra-de-Amolar, a da Areia, a Molha-Afunda, entre outras. Na atualidade, somente existem cachoeiras no trecho da ponte do Curupa à foz do rio Uruçuí Vermelho, destacando-se a da Taboca como mais importante.